بخش جراحی مغز و اعصاب دانشگاه علوم پزشکی مشهد در سال 1364 به همت اساتید محترم دکتر علیرضا بیرجندی و شادروان دکتر غلامرضا امیرشیبانی بعنوان بخش مستقل در دانشگاه (در بیمارستان قائم(عج)) افتتاح شد.

این دپارتمان در حال حاضر بزرگترین دپارتمان جراحی اعصاب شرق ایران بوده و دارای 12 عضو هیئت علمی جراحی اعصاب (3 استاد، 5 دانشیار و 4 استادیار) 2 عضو هیئت بورد کشوری و6 عضو هیئت علمی دارای فلوشیپ تایید شده وزارت متبوع در رشته های استرئوتاکسی، نوروواسکولار، نورواندوواسکولار و ستون فقرات (spine) می باشد و سالانه حدود 3000 عمل جراحی اعصاب شامل نوروتروما، تومورهای مغزی، جراحی عروق مغزی، اندونوروواسکولار، ستون فقرات، قاعده جمجمه،نورو اندوسکوپی، استرئوتاکسی و اطفال در سه مرکز مستقل وابسته به این دپارتمان انجام می شود و تاکنون بیش از 100 رزیدنت از این دپارتمان فارغ التحصیل شده و مشغول به خدمت در سطح کشور می باشد.

3 بخش مستقل جراحی اعصاب خدمات دهنده به بیماران در3 مرکز آموزشی دانشگاه یعنی بیمارستان های قائم (عج)، امدادی شهید کامیاب و کودکان اکبر  واقع شده اند و بیماران در 8 Neuro ICU  (6 بخش در امدادی و 2 بخش در قائم) تحت مراقبت قرار می گیرند.

دپارتمان جراحی اعصاب مشهد ظرفیت پذیرش 6-8 رزیدنت در سال را دارد که بصورت چرخشی در مراکز فوق آموزش می بینند. این دپارتمان مجهز به آزمایشگاه میکرو نوروسرجری فعال می باشد و برنامه های آموزشی مدون در جهت ارتقاء سطح علمی دستیاران طراحی شده است .

مرکز مهارت های بالینی دانشگاه و مرکز پژوهش های بالینی بیمارستان قائم (عج)دو مرکزی هستند که در آموزش و پژوهش دستیاران با این بخش همکاری دارند.

پذیرش دوره فلوشیپ در رشته نورواندوواسکولار از سال 1399 آغاز وتاکنون 6 فارغ التحصیل آن در دانشگاه های بزرگ کشور مشغول بکار می باشند.

پذیرش دوره فلوشیپ در رشته جراحی ستون فقرات از سال 1402 آغاز شده است.

پذیرش دوره فلوشیپ در سایر رشته ها  از اهداف آینده دپارتمان جراحی مغز و اعصاب دانشگاه علوم پزشکی مشهد می باشد.